Langs de kustvlakte van Nayarit stuitten de Spaanse veroveraars in de zestiende eeuw op een reeks kleine domeinen met meer of minder invloed, waarvan Aztátlan, Centícpac en Tzapotzingo de belangrijkste waren. De heersende stad van deze domeinen lag aan de kust en was in handen van de Totorame. Niettemin had het domein Aztátlan enkele dorpen opgenomen die behoorden totHet domein van Centícpac was er ook in geslaagd om verschillende Cora en Zayahueco dorpen te domineren en te veranderen in zijrivieren.
De mensen uit de bergen, die zout moesten halen aan de kust, kwamen van tijd tot tijd naar beneden om te handelen voor zout, vis en vlees. Ze brachten maïs en bonen mee, sotol wijn, honing, was, herten- en wilde-varkenshuiden, kostbare veren en gekooide vogels.
Vanwege de behoefte aan zout vielen de Cora onder de macht van de Spanjaarden, die garnizoenen oprichtten op de punten waar de zoutroutes uit de bergen afdaalden. Onder de zoutvelden bevonden zich die van Olita (in de buurt van de huidige stad Acaponeta), waar de Cora zich bevoorraadden met dit gewaardeerde product. Onder druk van de Spaanse controle over de handelsroutes besloten de Cora in 1721 omoproep aan de onderkoning van Nieuw-Spanje, Baltasar de Zúñiga, markies van Valero. Onder leiding van opperhoofd Tonati van de Mesa del Nayar stelde een delegatie aan de onderkoning voor dat de Indianen de heerschappij van de Spaanse Kroon zouden aanvaarden als aan de volgende voorwaarden werd voldaan: de rechten van de Cora op hun land en hun inheemse regering zouden vanaf dat moment worden gerespecteerd; de Spanjaarden zouden ook gelijkwaardige rechten onder deandere inboorlingen van de Sierra; de Cora zouden geen schatting meer hoeven te betalen; ze zouden vrije toegang krijgen tot de steden Acaponeta en Mexcaltítan om belastingvrij zout te winnen; en alle geschillen en problemen zouden alleen door de onderkoning worden opgelost.
Na de terugkeer van de delegatie namen de Spanjaarden op 17 februari 1722 de Mesa del Nayar in beslag en volgde een nieuwe reeks gebeurtenissen. De Spanjaarden stichtten missies en forten in Santa Teresa in Cuaimaruzi en Santísima Trinidad op de Mesa. Ze stichtten ook een reeks dorpen langs wat toen de "grens van San Luis Colotlan" werd genoemd, in wat nu de staat Jalisco is. Deze dorpenwaren bedoeld om mijncentra, zoals Los Bolaños, te beschermen tegen de aanvallen van de Coras-nayaritas, die zich nog steeds verzetten tegen de verovering. Tot deze grens behoorden ook San Sebastián, San Andrés Cohamiata en Santa Catarina, waarvan de economische basis de zouthandel was. De Sierra werd vervolgens volledig opgenomen in het koloniale rijk en werd onderdeel van het Nuevo Reino de Toledo.
Vanaf het begin verspreidden jezuïeten het christendom onder de Cora. De jezuïeten werden in 1767 door Karel III verbannen uit Nieuw-Spanje. Na hun vertrek kregen de franciscanen de leiding over de evangelisatie van de Cora. De franciscanen trokken zich honderd jaar later terug uit de regio om te ontsnappen aan de gevechten die werden uitgelokt door de Onafhankelijkheidsoorlog.
De mijncentra van Bolaños en Zacatecas raakten halverwege de negentiende eeuw in verval. Mestiezen uit deze regio's trokken de Sierra in om de landbouwgronden van de Tepecano, Huichol en Cora in beslag te nemen. In 1857 lokten deze inbeslagnames een gewapende reactie van de Indianen uit. Onder leiding van Manuel Lozada vochten de Indianen voor hun onafhankelijkheid tijdens de regeringen van Benito Juárez enSebastián Lerdo de Tejada. Lozada werd uiteindelijk verslagen en de Cora, Huichol en Tepehuan keerden terug naar hun gesloten Indiaanse werelden.
In 1895 onderzocht de etnoloog Carl Lumholtz de Sierra Madre Occidental en merkte de landconflicten op die veroorzaakt werden door het landjepik van de mestiezen.
Op 25 augustus 1939 werd de gemeente El Nayar opgericht, die een groot deel van Cora omvatte, met als hoofdstad Jesús María. In 1962 keerden de franciscanen terug om het evangelisatiewerk voort te zetten. Onder leiding van een missiebisschop over het Cora-, Huichol- en Tepehuan-gebied, werkten ze aan de wederopbouw van de achttiende-eeuwse kerken. In 1967 kwam het Instituto Nacional Indigenista in de regio. Zijzette de eerste medische dienst op onder de Cora, organiseerde tweetalige assistent-voorlichters en voerde nationale actieprogramma's uit om de Indianen te helpen.
De huidige relaties tussen de Cora en hun Huichol en Tepehuan buren zijn hartelijk tot op zekere hoogte, meestal het punt waarop landeigendommen worden betwist. Aan de andere kant zijn landeigendommen een constant probleem tussen de Cora en de mestiezen.
Lees ook artikel over Cora van Wikipedia